NOMENCLATURA E REPRESENTAÇÕES DOS AMINOÁCIDOS
Os aminoácidos foram denominados com nomes
comuns de acordo com três critérios: 1. a fonte a partir da qual eles foram
pela primeira vez obtidos na forma pura, como a tirosina, (termo que vem de
tyros, do grego, que significa queijo) nomeada assim por ter sido obtida do
queijo. A asparagina, assim denominada por que foi obtida do aspargo; 2. uma
característica química do aminoácido, como por exemplo a fenilalanina, assim
nomeada por apresentar um grupo fenil ligado ao aminoácido alanina; e 3. uma
propriedade do aminoácido, como, por exemplo, a glicina, que recebe esse nome
por ter o sabor doce, lembrando os glicídios (açúcares). A maioria dos
aminoácidos tem seus nomes terminados com o sufixo “ina”, como: prolina,
glicina, alanina asparagina, etc. Outros têm nomes terminados em “ano”, como o
triptofano e em “ico”, como o ácido aspártico e o ácido glutâmico. O ácido
aspártico e o ácido glutâmico, em suas formas ionizadas, apresentam carga
líqüida negativa, sendo nomeados aspartato e glutamato, respectivamente, uma
vez que a terminação “ato” é usada para designar os ácidos carregados
negativamente. A tabela 1 traz os 20 aminoácidos padrões, acompanhados das
abreviaturas de uma e de três letras. Essas abreviaturas são utilizadas para
descrever de forma prática a seqüência de aminoácidos das proteínas. A regra
seguida na abreviatura de três letras da maioria dos aminoácidos consiste em
registrar as três primeiras letras iniciais do seu nome em inglês. A abreviatura
de uma letra é usada em textos científicos quando se quer comparar as
seqüências de aminoácidos de diversas proteínas. Essa abreviatura é feita, para
a maior parte dos aminoácidos, usando a primeira letra do nome do aminoácido
correspondente. Alguns têm símbolos que não têm nenhuma relação com os seus
nomes, como por exemplo, o 3 triptofano e a lisina, que são representados por W
e K, respectivamente. Como já existem dois aminoácidos representados pelas
letras L (a leucina) e T (a treonina), convencionou-se representar a lisina com
a letra K e o triptofano com a letra W.

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